故事延续第二季主线，灵界与斗魂卫在利益纠葛之下冲突不断，本季灵界派出强盛军队欲对斗魂卫赶尽杀绝，两方势力都在以正在举办门宗大会的五法山为中心汇集，在这里发生着惨烈的战斗与冲突。
主人公林峰本是天才机器人工程师，为了提升其所研发的超能机器人的机能，他费尽千辛万苦，从深渊之中挖掘出了神秘的上古至宝——祖龙之眸，而正当其欲将祖龙之眸的能量，转化入超能机器人之中时，龙眸内的神力被意外激发，引发时空漩涡，将林峰带到了崇尚武道的古神大陆，转世重生。重生的林峰被封印了前世的记忆，成为了一个只觉醒了治疗系武魂的平庸人士，备受冷眼，甚至惨遭未婚妻的悔婚。其未婚妻的族人为了斩草除根，狠心袭杀林峰。危机时刻，林峰觉醒了关于祖龙之眸的记忆，并惊喜发现龙眸的神力已成功与其所研发的超能机器人所融合。随后，在超能机器人的帮助之下，他逐渐掌控了祖龙之眸的神力，踏上了强者之路。
许正阳，一位曾雄心勃勃却因市场无情而跌入谷底的创业者，正站在人生的十字路口，手中紧握着来之不易的新一轮创业资金，誓要卷土重来。就在这关键时刻，一道不可思议的光芒划破了他黯淡的世界——一个神秘系统悄然降临，带来了震撼人心的消息：全球范围内，所有物价奇迹般地暴跌了一百万倍，唯有许正阳手中的资金，如同时间静止般，保持着原有的价值。这一突如其来的变故，瞬间将他推上了全球财富之巅，其资产之巨，远超昔日的任何一位世界首富。
星猫和十二星座战士将黑魔王封印在宇宙的深处。 时间流转，三百年后，新一代的小星猫诞生了。 为了有一天能够像自己崇敬的偶像一样和黑魔王战斗，对于知识的学习和自身的锻炼，小星猫可是从来也没有放松过。 这一天，天神星发现了星猫基地的遗迹，小星猫和十二星座伙伴们偷偷潜上了飞船正玩得开心，突然黑魔王的身影再次出现在天空！在不知道该如何是好的小星猫面前，突然出现了三百年前的星猫和伙伴们留下的讯息。原来早在三百年前，星猫就已经预料到黑魔王会有解开封印的一天，所以特地留下了三样宝物！小星猫和伙伴们在飞船上和黑魔王的爪牙小黑怪展开了一场斗智斗勇的战斗，他们成功地发动了超级飞船飞向宇宙深处，寻找精神之光和能够打倒黑魔王的力量——星猫宝藏。
主人公园丁打算坐飞机去动漫乐园游玩，不料还未登机时却误入到了朵雅大陆。这个大陆是多元宇宙论中无限个宇宙集合中的其中一个。园丁见识到了美丽的朔月学院，地龙拉着的马车，天空中学员使用魔法决斗，对于游戏老玩家的园丁来说很快地适应和认知到了自己已经来到朵雅大陆的局面。
与世无争只想过平静生活的食草龙，遇上了中二少女玲子。由于无论它怎么好言相劝都无法劝退一心向死的玲子，无计可施的它只能编造谎言，好让玲子活下去。在“邪龙”编造的谎言下，玲子与她认定的最强“邪龙”一同踏上了讨伐魔王军的征程。
万族咆哮，撕裂苍穹！全面转职时代彻底降临！觉醒日，李一觉醒至高阴神职业——阴司至尊！生死簿翻页，万灵寿数由吾定；轮回盘转动，诸界亡魂归吾掌！十万鬼将，百万阴兵，一念断生，一念断死，诸天万界我为尊，吾意即天意！面对异族屠戮，人族悲歌响彻寰宇之际。李一突破职业桎梏，成就酆都大帝，硬撼异族三大邪神！阴司之主，既掌生死，亦镇苍生！那一战，天地震动！最终李一成功消灭邪神异族，将和平与安宁再次带给了这颗饱经风霜的星球！
某一天，地球上出现了不明来由的RR病毒，将世界卷入灾难之中。受到感染的动物变异成为可怕的怪兽，大举入侵，人类面临毁灭之际筑起了围墙，成立基地市作为人类最后的堡垒。人类在这一段时间经历的磨难，被称为“大涅槃时期”。在极端的生存环境下，人类的体能也在逐渐地进步发展，尚武之风兴起，人类的身体素质相比以前有了质的飞越。而这其中的佼佼者，被称为“武者”。 18岁的罗峰也梦想着成为其中的一员。此时的他即将高考，正面临着人生十字路口的抉择，却不料怪兽的一次袭击影响了他的人生轨迹。在强大怪兽的威胁之下，市内居民面临危险，军方却束手无策。唯有一名武者挺身而出，保卫了基地市的安全。罗峰被武者的强大所感染，暗自立下成为武者以保护所爱之人的决心。这是一切的开始，罗峰武者之路的起点，也拉开了他传奇人生的序幕。 罗峰立志成为武者，前路却并不平坦，他首先要面对的便是外部环境无形中对他施加的影响。罗峰家庭条件不佳，生活拮据，父母无法给予他更多帮助，只能依靠自己的努力。最终，在不断的艰苦磨砺下，罗峰不断发掘自身潜能，得到了能力提升和自我价值的认可。不仅如此，罗峰不仅扛起了供养家庭的重担，还为了守护人类家园、为了人类更好的生存与发展，与其他正义的武者们一起，联手对付凶恶怪兽。在末日绝境之下，罗峰与其他武者们能否击退怪兽、成功守护人类世界？
